ISPITIVANJE KORECEPTORSKOG TROPIZMA VIRUSA KOD PACIJENATA SA NOVODIJAGNOSTIKOVANOM INFEKCIJOM VIRUSOM HUMANE IMUNODEFICIJENCIJE
Sažetak
Cilj rada: Cilj ovog rada je bio da se ispita koreceptorski tropizam kod pacijenata sa novodijagnostikovanom HIV infekcijom.
Uvod: Sposobnost virusa humane imunodeficijencije (HIV) da koristi CCR5 ili CXCR4 ili oba koreceptora za ulazak u ćeliju se naziva koreceptorski tropizam. Tropizam virusa zavisi od strukture površnog virusnog glikoproteina koji služi za pripajanje virusa za receptor i koreceptor. Virusi koji koriste CCR5 koreceptor su označeni kao R5 sojevi, a virusi koji koriste CXCR4 koreceptor kao X4 sojevi, dok su oni koji koriste oba koreceptora označeni kao X4R5 sojevi (dvojni/mešani tropizam). Na početku HIV infekcije, neposredno po transmisiji virusa kod većine inficiranih osoba preovlađuju R5 forme. U daljem toku infekcije, sa napredovanjem HIV bolesti, kod nekih pacijenata se pojavljuju X4 forme.
Materijal i metode: U ispitivanje je uključeno 26 pacijenata praćenih na Klinici za infektivne i tropske bolesti KCS, u periodu od 2010. do 2012. godine. Nizom postupaka izolacije, prečišćavanja i PCR umnožavanja su dobijeni PCR produkti dela env gena, koji su zatim obrađeni DNK sekvenciranjem. Dobijene sekvence analizirane su Geno2pheno bioinformatičkim algoritmom za određivanje koreceptorskog tropizma.
Rezultati: Prisustvo R5 soja je ustanovljeno kod 21/26 (81%), a X4 kod 5/26 (19%) ispitanika. U C3 stadijumu infekcije je bilo 5/26 (19,2%) pacijenata i svi su bili zaraženi sojem sa tropizmom za CCR5 koreceptor. Četrnaest pacijenata (56%) spada u grupu kasnih prezentera HIV infekcije, od kojih je 12 (86%) inficirano R5 sojem.
Zaključak: Dobijeni rezultati ukazuju da kod pacijenata sa novodijagnostikovanom HIV infekcijom u Srbiji preovlađuju R5 sojevi virusa, mada zastupljenost X4 varijanti nije zanemarljiva. Uočena učestalost X4 sojeva virusa među pacijentima sa novodijagnostikovanom HIV infekcijom pokazuje da CCR5 inhibitori ne bi delovali u 19% ispitivanih pacijenata, što ukazuje na značaj određivanja koreceptorskog tropizma.
Ključne reči: HIV, R5 sojevi, X4 sojevi, koreceptorski tropizam, geno2pheno bioinformatički algoritam
Reference
Moore J, Doms R. The entry of entry inhibitors: A fusion of science and medicine. Proc Natl Acad Sci. 2003;100(19):10598–602.
Benedikt S, Grabmeier-Pfistershammer K, Rieger A, Sarcletti M, Schmied B, Puchhammer-Stöckl E. HIV coreceptor tropism in antiretroviral treatment-naive patients newly diagnosed at a late stage of HIV infection. AIDS. 2010; 24(13):2051–8.
Wilkin TJ, Su Z, Kuritzkes D, Hughes M, Flexner C, Gross R. et al. HIV Type 1 Chemokine Coreceptor Use among Antiretroviral-Experienced Patients Screened for a Clinical Trial of a CCR5 Inhibitor: AIDS Clinical Trial Group A5211. Clin Infect Dis. 2007;44(4):591–5.
Chalmet K, Dauwe K, Fouquet L, Baatz F, Seguin-Devaux C, Van Der Gucht B, et al. Presence of CXCR4-Using HIV-1 in Patients With Recently Diagnosed Infection: Correlates and Evidence for Transmission. J Infect Dis. 2012;205(2):174-84.
Williamson S. Adaptation in the env gene of HIV-1 and evolutionary theories of disease progression. Mol biol evol. 2003;20(8):1318-25.
Archer JP. The Diversity of HIV-1. Manchester: University of Manchester; 2008.
Koot M, Keet IP, Vos AH, de Goede RE, Roos MT, Coutinho RA, et al. Prognostic value of HIV-1 syncytium inducing phenotype for rate of CD4+ cell depletion and progression to AIDS. Ann Int Med. 1993;118(9):681–8.
Feng Y, Broder CC, Kennedy PE, Berger EA. HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor. Science 1996; 272(5263):872–7
Sierra-Enguita R, Rodriguez C, Aguilera A, Gutierrez F, Eiros JM, Caballero E et al. X4 tropic viruses are on the rise in recent HIV-1 seroconverters in Spain. AIDS. 2014;28(11):1603-9.
Raymond S, Delobel P, Mavigner M, Cazabat M, Encinas S, Souyris C et al. CXCR4-using viruses in plasma and peripheral blood mononuclear cells during primary HIV-1 infection and impact on disease progression. AIDS. 2010;24(15):2305-12.
Parisi SG, Andreoni C, Sarmati L, Boldrin C, Buonomini AR, Andreis S et al. HIV Coreceptor Tropism in Paired Plasma, Peripheral Blood Mononuclear Cell, and Cerebrospinal Fluid Isolates from Antiretroviral-Naïve Subjects. J Clin Microbiol. 2011;49(4):1441-5.
Parczewski M, Leszczyszyn-Pynka M, Witak-Jędra M, Maciejewska K, Myślińska S, Urbańska A. The temporal increase in HIV-1 non-R5 tropism frequency among newly diagnosed patients from northern Poland is associated with clustered transmissions. J Int AIDS Soc [Internet]. 2015 avgust [pristupljeno 2016 februar 10]; 18(1). Dostupno na: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4545195/
Henrich TJ, McLaren PJ, Rao S, Lin NH, Hanhauser E, Giguel F et al. Genome-Wide Association Study of Human Immunodeficiency Virus (HIV)-1 Coreceptor Usage in Treatment –Naïve Patients from An AIDS Clinical Trials Group Study. OFID. 2014;1(1):1-7.
Poveda E, Briz V, Quinones-Mateu M, Soriano V. HIV tropism: diagnostic tools and implications for disease progression and treatment with entry inhibitors. AIDS. 2006;20(10):1359-67.
Siljic M, Salemovic D, Stanojevic M, Pesic-Pavlovic I, Zerjav S, Nikolic V. et al. Molecular typing of the local HIV-1 epidemic in Serbia. Infect Genet Evol. 2013;19:378-85.
Institut za javno zdravlje Srbije. Istraživanja među populacijama pod povećanim rizikom od HIV-a. [Internet] Beograd: Institut za javno zdravlje Srbije; 2012 septembar [pristupljeno 2016 februar 15]. Dostupno na:
Antinori A, Coenen T, Costagiola D, Dedes N, Ellefson M, Gatell J. et al. Late presentation of HIV infection: a consensus definition. HIV med. 2011;12(1):61-4.
Stanojevic M, Siljic M, Salemovic D, Pesic-Pavlovic I, Zerjav S, Nikolic V. et al. Ten years survey of primary HIV-1 resistance in Serbia: the occurrence of multiclass resistance. AIDS Res Hum Retroviruses. 2014;30(7):634-41.
