Predviđanje štetnih efekata sulforafana in silico ispitivanjem njegovog ciljanog dejstva na gene, protein-protein interakcije i klase molekula

  • Katarina Živančević Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“; Univezitet u Beogradu – Biološki fakultet, Institut za fiziologiju i biohemiju ,,Ivan Đaja“
  • Katarina Baralić Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Dragica Božić Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Dragana Javorac Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Đurđica Marić Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Evica Antonijević Miljaković Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Aleksandra Buha Đorđević Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Marijana Ćurčić Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Zorica Bulat Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Biljana Antonijević Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“
  • Danijela Djukić-Ćosić Univezitet u Beogradu – Farmaceutski fakultet, Katedra za toksikologiju ,,Akademik Danilo Soldatović“

Sažetak


Alternativni oblik lečenja raka uključuje upotrebu prirodnih jedinjenja kao što je fitohemikalija bogata sumporom, sulforafan (SFN). Međutim, podaci o interakcijama SFN na nivou proteina i ciljnih mesta dejstva SFN u ljudskom organizmu su ograničeni. Cilj ove studije bio je da se ukaže na ciljne interakcije SFN kod ljudi kako bi se racionalizovali mogući neželjeni efekti i predvidela nova ciljna mesta toksičnosti korišćenjem in silico pristupa. STITCH baza podataka (http://stitch.embl.de) korišćena je za dobijanje informacija o interakcijama između hemikalija i proteina, dok je Metascape (https://metascape.org/) izdvojio protein-protein interakcije (PPIE). SwissTargetPrediction (http://vvv.svisstargetprediction.ch/) ukazao je na ciljana mesta dejstva SFN kod ljudi. Izdvojeni su geni koji kod ljudi imaju najjaču interakciju sa SFN: NQO1, NFE2L2, CASP3, HSP90AA1, MAPK14, HDAC6, HPGDS, KEAP1, GSTA1, GSTM1. Ateroskleroza, NRF2 signalni put i hemijska karcinogeneza - reaktivne vrste kiseonika (ROS) označeni su kao najznačajnije protein-protein interakcije. Najzastupljenija klasa SFN ciljanih molekula u ljudskom organizmu bili su enzimi (26,7%). Receptor epidermalnog faktora rasta erbB1, faktor inhibitora migracije makrofaga i sintaza azot oksida (inducibilna) pokazali su najveću stopu verovatnoće ciljnog mesta dejstva. U našoj prethodnoj studiji istakli smo da bi genom pacijenata obolelih od raka mogao uticati na bezbednost primene SFN. Međutim, ova studija daje dodatni set ciljnih gena i naglašava važnost oksidativnog stresa u predloženim interakcijama između gena, kao i predviđenim klasama ciljnih molekula na koje deluje SFN i koje bi trebalo dalje ispitati.

Reference

Elkashty OA, Tran SD. Sulforaphane as a Promising Natural Molecule for Cancer Prevention and Treatment. Curr Med Sci. 2021 Apr; 41(2):250-269.

Bozic D, Baralić K, Živančević K, Miljaković EA, Ćurčić M, Antonijević B, Djordjević AB, Bulat Z, Zhang Y, Yang L, Đukić-Ćosić D. Predicting sulforaphane-induced adverse effects in colon cancer patients via in silico investigation. Biomed Pharmacother. 2022 Feb;146:112598.

Objavljeno
2022/10/18
Broj časopisa
Vol. 72 Br. Suppl. 4 (2022): Arhiv za farmaciju - VIII Kongres farmaceuta Srbije sa međunarodnim učešćem
Rubrika
Poster prezentacije sekcije Toksikologija
Autori koji objavljuju u ovom časopisu pristaju na sledeće uslove:

  1. Autori zadržavaju autorska prava i pružaju časopisu pravo prvog objavljivanja rada i licenciraju ga "Creative Commons Attribution licencom" koja omogućava drugima da dele rad, uz uslov navođenja autorstva i izvornog objavljivanja u ovom časopisu.

  2. Autori mogu izraditi zasebne, ugovorne aranžmane za neekskluzivnu distribuciju članka objavljenog u časopisu (npr. postavljanje u institucionalni repozitorijum ili objavljivanje u knjizi), uz navođenje da je članak izvorno objavljen u ovom časopisu.

  3. Autorima je dozvoljeno i podstiču se da postave objavljeni članak onlajn (npr. u institucionalni repozitorijum ili na svoju internet stranicu) pre ili tokom postupka prijave rukopisa, s obzirom da takav postupak može voditi produktivnoj razmeni ideja i ranijoj i većoj citiranosti objavljenog članka (Vidi Efekti otvorenog pristupa).